Es gibt die folgenden sieben Hauptmenüpunkte:

1. Datei
2. Bearbeiten
3. Ansicht
4. Bild
5. Ebenen
6. Korrektur
7. Effekte

Außerdem sind in der Leiste rechts oben noch die Punkt Hilfe und Einstellungen verlinkt.

In früheren Version von Paint.Net gab es auch noch einen Menüpunkt Fenster